L’aplicació està adaptada al Pla General Contable i treballa a 8 nivells amb comptes de 3xifres i subcomptes de 8 dígits. Els grups, subgrups i comptes de nivell 3 ja estan predefinits al programa, encara que poden ser rectificats per l’usuari.

A cada conveni es defineixen els diferents conceptes que l’integren. Així mateix, es defineix l’estructura de pagues extraordinàries i de vacances i els possibles complements en casos d’incapacitat temporal per malaltia i accident. S’estructuren els nivells retributius amb les diferents categories professionals.
NOMINA3 disposa, a més, de la possibilitat de consultar i descarregar un document PDF amb les dades actualitzades dels convenis oficials publicats a nivell estatal i provincial.

Cada empresa i cada treballador disposa d’una fitxa individual on es consignaran les dades necessàries per a la correcta identificació de la situació laboral i del conveni associat. En el cas dels treballadors, el programa compta amb la possibilitat de crear diferents fitxes de variació per als diferents canvis contractuals que es poden donar al llarg de la seva vida
laboral a l’empresa.
Per facilitar l’entrada inicial de dades, tots dos fitxers poden rebre dades automàticament a través de la importació dels moviments d’un fitxer ITA (Informe de Treballadors a Alta) de la TGSS.

A partir de les dades introduïdes als convenis, el programa calcularà els salaris dels treballadors.
El càlcul de salaris es fa un cop seleccionat el període (mesos de l’any, pagues extraordinàries i endarreriments) i entrades les incidències (retribucions variables i absentismes) del període a meritar.
S’han previst els motius d’absentisme següents: vacances, permís retribuït, permís no retribuït, vaga o sanció, malaltia, recaiguda, accident (amb hospitalització o sense), maternitat o paternitat, accident de treball… Els salaris calculats mostren el detall dels conceptes salarials, valors unitaris, quantitats, liquidacions, descomptes, retencions, bestretes i altres deduccions.

En efectuar qualsevol modificació posterior al càlcul inicial, el programa recalcula els conceptes, l’import meritat, les bases de cotització, les retencions i l’import líquid del full salarial. Des de la mateixa pantalla de càlcul podem visualitzar, imprimir i revisar períodes anteriors.

Permet l’entrada d’incidències salarials, mensuals o per a un període determinat, que afectaran el salari d’un treballador determinat, més enllà del nivell retributiu. Una de les opcions que es pot introduir és l’anotació d’embargaments, que el programa aplicarà successivament i en la proporció adequada en calcular els salaris, fins a aplicar-ne la totalitat.

El càlcul de salaris genera automàticament la informació necessària per confeccionar els trams de cotització dels treballadors. Aquesta informació es trasllada fàcilment en forma d’enregistrament de fitxer electrònic per a SILTRA, en els formats previstos per la TGSS.
Totes les respostes rebudes a SILTRA poden interpretar-se des del programa per a la seva immediata identificació i relació amb les empreses i/o treballadors a qui puguin afectar. El programa permet sol·licitar i incorporar els costos de Seguretat Social que calcula la TGSS i comparar-los amb l’esborrany que genera el programa. En paral·lel a les obligacions de cotització, el programa també genera els fitxers dels Conceptes Retributius Abonats (CRA).

El programa calcula i actualitza en cada període els acumulats i els percentatges de retenció coherents amb les percepcions anuals dels treballadors i la situació familiar. Aquesta informació es trasllada als models 111 i 190 per a l’Agència Tributària, en forma de llistat resum o en forma de fitxer telemàtic, apte per presentar-los a la Seu Electrònica.
També es poden entrar les dades corresponents a perceptors externs subjectes a retenció d’IRPF per activitat econòmica. Es pot obtenir una plantilla del model 145 de Comunicació de dades al pagador, per lliurar-la als treballadors, a fi que anotin la seva situació personal i familiar que afecti el correcte càlcul de l’IRPF.

Els rebuts de salari es poden mostrar per a un treballador individual, d’una empresa o de totes
elles. Poden obtenir-se en format per impressió, exportar-se a PDF o formar part d’un enviament automàtic de correu electrònic a empreses o treballadors.
El programa permet, opcionalment, confeccionar els xecs d’una empresa determinada, imprimir una relació de transferències o gravar-les segons la norma SEPA per enviar-les a les entitats bancàries.

En crear una fitxa de treballador, donar com a finalitzada una relació laboral o generar-ne una variació, el programa genera un fitxer electrònic relatiu als processos d’afiliació (altes, baixes, variacions) per al Sistema de la TGSS a través de la aplicació SILTRA (fitxers AFI), els fitxers de comunicació a la contractació (Contracte@) i els certificats d’empresa (Certific@2) del Servei Públic d’Ocupació.
El programa compta amb una eina d’interpretació dels fitxers de resposta rebuts del Servei Públic d’Ocupació per comprovar les incidències o els possibles errors comesos a l’enviament.
Els contractes també es poden confeccionar per a la seva impressió a partir dels models predefinits al programa. Un cop confeccionats es poden emmagatzemar a la fitxa del treballador per a la posterior consulta.

El programa permet l’enregistrament dels fitxers electrònics FDI per a la comunicació de baixes, altes i parts de confirmació de processos d’IT, així com els certificats d’empresa per a la sol·licitud de prestacions per naixement o cura del menor, mitjançant l’aplicació SILTRA .
Addicionalment, també es poden obtenir en format per a la seva impressió els certificats d’empresa de sol·licitud de prestacions per naixement o cura del menor, de risc per embaràs, incapacitat temporal o jubilació.

Poden imprimir-se els resums anuals següents: absentisme, càlcul de vacances, càlcul de personal en plantilla, càlcul de personal assalariat, meritacions anuals, costos salarials i registre valor del salari mitjà.